2001-

1 lipca

Rozpoczęły działalność następujące spółki zależne:

• Linia Hutnicza Szerokotorowa Sp. z o.o. w Zamościu,
• PKP Warszawska Kolej Dojazdowa Sp. z o.o. w Grodzisku Mazowieckim, 
• PKP Szybka Kolej Miejska w Trójmieście Sp. z o.o. w Gdyni, 
• CS Szkolenie i Doradztwo Sp. z o.o. w Warszawie, 
• Dolnośląskie Przedsiębiorstwo Napraw Infrastruktury Komunikacyjnej DOLKOM Sp. z o.o. we Wrocławiu. 

1 września

Rozpoczęły działalność następujące spółki zależne:

• Pomorskie Przedsiębiorstwo Mechaniczo-Torowe Sp. z o.o. w Gdańsku, 
• Zakład Robót Komunikacyjnych DOM w Poznaniu Sp. z o.o., 
• Zakład Napraw Infrastruktury Sp. z o.o w Warszawie, 
• Zakład Robót Inżynieryjnych Sp. z o.o w Warszawie,
• FERPOL Sp. z o.o. w Warszawie, 
• Farmacja Kolejowa Sp. z o.o. w Warszawie, 
• PKP Intercity Sp. z o.o w Warszawie.

1 października

Rozpoczęły działalność następujące spółki zależne:

• Przedsiębiorstwo Napraw i Utrzymania Infrastruktury Kolejowej Sp. z o.o. w Krakowie,
• Przedsiębiorstwo Utrzymania Infrastruktury Kolejowej Sp. z o.o. w Katowicach, 
• Zakład Napraw Infrastruktury Radom Sp. z o.o., 
• Zakład Napraw Infrastruktury Sp. z o.o. w Stargardzie Szczecińskim,
• PKP Polskie Linie Kolejowe S.A. w Warszawie,
• PKP Cargo S.A. w Katowicach,
• PKP Przewozy Regionalne Sp. z o.o. w Warszawie,
• PKP Energetyka Sp. z o.o. w Warszawie,
• Telekomunikacja Kolejowa Sp. z o.o. w Warszawie,
• PKP Informatyka Sp. z o.o. w Warszawie,
• WAGREM Sp. z o.o. w Kluczborku,
• Gorzów Wagony Sp. z o.o. w Gorzowie Wielkopolskim.

Tym samym powstała Grupa Kapitałowa PKP S.A., zorganizowana w postaci holdingu, w ramach którego funkcjonują w/w spółki zależne.